Halk sağlığı alanında yürüttüğü çok yönlü çalışmalarıyla, Türkiye’de koruyucu sağlık politikalarının şekillenmesinde öncü rol üstlenen isimler arasında yer aldı.
Meslek hayatının ilk yıllarında Elazığ İl Sağlık Müdürlüğü bünyesinde şube müdürlüğü ve il sağlık müdür yardımcılığı görevlerinde bulundu. 1997 yılından itibaren Sağlık Bakanlığı merkez teşkilatında görev alarak aile hekimliği yapılanması, ruh sağlığı hizmetleri ve madde bağımlılığıyla mücadele alanlarında önemli sorumluluklar üstlendi. Bu süreçte, Türkiye’de yalnızca tütün ve alkol kullanımıyla mücadeleye odaklanan Tütün ve Alkol Kullanımı ile Mücadele Daire Başkanlığı’nın kurulmasına öncülük etti.
Prof. Dr. Ergüder, 2000–2003 yılları arasında Türkiye’yi Dünya Sağlık Örgütü nezdinde Cenevre’de yürütülen Tütün Kontrolü Çerçeve Sözleşmesi müzakerelerinde temsil etti. Sözleşmenin Türkiye tarafından imzalanması ve onaylanması sürecinde aktif rol aldı. Aynı dönemde, 5727 sayılı “Tütün Mamullerinin Zararlarının Önlenmesine Dair Kanun”un hazırlanması ve TBMM’deki görüşmeleri sırasında uzman katkısı sundu. 2007 yılında yayımlanan Türkiye’nin ilk Ulusal Tütün Kontrol Programı ve Eylem Planı, bu alandaki kurumsal mücadelenin temel taşlarından biri oldu.
Akademik kariyerine Hacettepe Üniversitesi Halk Sağlığı Enstitüsü’nde devam eden Prof. Dr. Ergüder, 2017 yılında Sağlık Bilimleri Üniversitesi Gülhane Tıp Fakültesi Halk Sağlığı Anabilim Dalı’na profesör olarak atandı. Aynı zamanda Yeşilay Bilim Kurulu Üyesi olarak, bağımlılıklarla mücadele alanındaki bilimsel çalışmalara katkı sundu.
2007–2025 yılları arasında Dünya Sağlık Örgütü Türkiye Ofisi’nde Bulaşıcı Olmayan Hastalıklar ve Sağlığın Geliştirilmesi Program Sorumlusu olarak görev yaptı. Bu kapsamda hipertansiyon kontrolü, tuz tüketiminin azaltılması, trans yağların eliminasyonu, dumansız hava sahası uygulamaları, teletıp ve yol trafik güvenliği gibi çok sayıda ulusal programın koordinasyonunu yürüttü. Türkiye’de ve dünyada referans kabul edilen Küresel Yetişkin ve Gençlik Tütün Kullanımı Araştırmaları ile Ulusal Kronik Hastalıklar ve Risk Faktörleri Araştırmalarının tasarım ve koordinasyonunda görev aldı.
Afet ve kriz dönemlerinde sahada aktif sorumluluk üstlenen Prof. Dr. Ergüder; Marmara Depremi’nden 6 Şubat Kahramanmaraş depremlerine, kuş gribi salgınından COVID-19 pandemisine kadar pek çok ulusal ve uluslararası acil durumda halk sağlığı hizmetlerinin koordinasyonunda yer aldı. Ayrıca Suriyeli göçmenlere yönelik sağlık hizmetlerinin planlanması ve yürütülmesinde önemli katkılar sağladı.
Bilimsel çalışmaları; sağlığın geliştirilmesi, kronik hastalıkların önlenmesi, tütün, alkol ve madde bağımlılığıyla mücadele alanlarında yoğunlaşmaktadır. Çok sayıda ulusal ve uluslararası yayını bulunan Prof. Dr. Ergüder, çeşitli bilimsel dergilerin danışma ve editoryal kurullarında görev almaktadır. Çalışmaları, ulusal ve uluslararası düzeyde çeşitli ödüllerle takdir edilmiştir.
Nisan 2025’te Cumhurbaşkanlığı Sağlık Politikaları Kurulu Üyeliğine, Aralık 2025’te ise Sağlık Bilimleri Üniversitesi bünyesinde kurulan Bulaşıcı Olmayan Hastalıklar ve Risk Faktörlerinin Önlenmesi, Kontrolü ve Yönetimi Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğüne atanmıştır.
Koruyucu sağlık hizmetlerini yalnızca tıbbi bir alan değil, toplumsal bir sorumluluk ve stratejik bir kamu politikası olarak ele alan Prof. Dr. Toker Ergüder, bilim, saha deneyimi ve politika üretimini aynı çizgide buluşturan çalışmalarıyla Türkiye’de halk sağlığı mücadelesine yön veren isimlerden biri olmaya devam etmektedir.
